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基因簇是指結(jié)構(gòu)和功能相似的同一家族的成員基因,簇狀排列在染色體上相對集中區(qū)域的現(xiàn)象。近期,瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的研究團隊借助基因組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)了多種海洋細菌生物合成基因簇,未來可能為相關(guān)領(lǐng)域研究提供啟示。相關(guān)成果在《Nature》發(fā)表,論文的標(biāo)題為:Biosynthetic potential of the global ocean microbiome。
研究團隊首先獲取了全球215個采樣點的不同深度層共1038個海水樣本的基因測序數(shù)據(jù),構(gòu)建了26293種海洋微生物基因組,其中2790種來自新發(fā)現(xiàn)的細菌。結(jié)合已公布的基因組數(shù)據(jù),研究人員創(chuàng)建了海洋微生物組學(xué)數(shù)據(jù)庫(OMD,Ocean Microbiomics Database),通過復(fù)雜的算法分析發(fā)現(xiàn)了39055個生物合成基因簇(BGCs,biosynthetic gene clusters),參與約6873種化合物的生物合成過程。進一步研究表明部分基因簇在亞磷酸鹽等化合物的生物合成中起著關(guān)鍵作用。
該研究通過基因組學(xué)方法發(fā)現(xiàn)了新型海洋細菌和生物合成基因簇,對海洋生態(tài)、生物進化和天然產(chǎn)物等領(lǐng)域的研究具有重要意義。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1038/s41586-022-04862-3
注:此研究成果摘自《Nature》,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場。
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關(guān)鍵詞: 生物合成 基因組學(xué) 海洋微生物
責(zé)任編輯:Rex_08